【初稿】 Kleefstra 综合征

Kleefstra Syndrome

9q亚端粒缺失综合征, 9q34.3 微缺失综合征, 9qSTDS
英文原文链接

, MD, PhD, , BSc, and , PhD.

Author Information

翻译者:谢波波,沈亦平

Initial Posting: 2017-09-01 11:51:55; Last Update: 2017-12-05 08:28:28.

概述

临床特征:Kleefstra 综合征主要表现为智力低下,儿童期肌张力低下和特殊面容。大部分病人有中度或重度智力低下,但也有少部分病人只是轻微的智力发育迟缓,总的IQ值可达 70。尽管大部分病人有严重的语言表达能力发育迟缓,但通常具有较高水平的一般性语言发育能力,能进行非言语性交流。Kleefstra 综合征病人可能还有先天性心脏病,肾脏或泌尿系统缺陷,男性有生殖器缺陷,严重的呼吸道感染, 癫痫或热性惊厥,儿童期具有孤独症类似症状,以及在青春期之后有极度的感情淡漠或 紧张性精神分裂症样的表现。

 
诊断/检测:约75%的Kleefstra 综合征患者为包含EHMT1基因的9q34.3区域杂合性缺失引起,约25%的患者为 EHMT1基因的致病性变异导致。

管理:症状治疗:针对智力残疾的儿童或成人,成立由多学科组成的团队进行专门的护理。对于适龄儿童,推荐早期干预、特殊教育或职业培训、发音/语言疗法、物理和职 业疗法、感觉统合疗法等方案。对于那些存在运动障碍、睡眠障碍和或癫痫等极端行为问题的病人需要特殊护理。针对心脏、肾脏、泌尿系统、耳聋以及其他的医学 问题进行常规治疗。

监督:监测心脏及肾脏/泌尿系统是否正常是很有必要的。

遗传咨询:Kleefstra综合征是一种常染色体遗传病,主要由9q34.3微缺失或 EHMT1基 因的致病性变异导致。 到目前为止,几乎所有病例的基因变异都是自发性的。已有罕见的报道显示,当父母在9q34.3的区域发生平衡易位或为9q34.3微缺失的体细胞嵌合体, 家庭中会出现多个 Kleefstra综合征患者。 除9q34.3微缺失嵌合体外,尚未见Kleefstra综合征患者能够生育后代。因为生殖系嵌合、包括生殖细胞在内的体细胞嵌合或染色体平衡易位都会增 加Kleefstra综合征的复发风险,所以对于已经生育过一个9q34.3微缺失或携带 EHMT1致病性变异患者的正常父母来说,可以进行产前检测。

 

诊断

Kleefstra综合征主要临床特征包括智力低下,儿童期肌张力低下和特殊面容,其他的临床表现可以参考如下文献[ Dawson et al 2002, Cormier-Daire et al 2003, Stewart et al 2004, Kleefstra et al 2005, Yatsenko et al 2005, Kleefstra et al 2006a, Kleefstra et al 2006b, Stewart & Kleefstra 2007, Kleefstra et al 2009, Yatsenko et al 2009].

提示性表现

具有如下临床表现的个体,应怀疑Kleefstra综合征:

  • 中度到重度的智力低下,并伴有严重的语言发育迟缓。
  • 特殊面容
  • 儿童期肌张力低下
  • 运动发育迟缓
  • 心脏病
  • 肾脏/泌尿系统疾病
  • 生殖器缺陷(男性)
  • 严重的呼吸道感染
  • 癫痫/热性惊厥
  • 儿童期有孤独症样特征
  • 青春期后有极度的感情淡漠或紧张性精神分裂 症样的表现
  • 大脑结构性异常
  • (脑及脊髓的)白质异常

建立诊断

先证者检测到包含EHMT1基因的9q34.3微缺失或EHMT1基因检测到致病性变异,即可诊断为Kleefstra综合征(表1)。[ Kleefstra et al 2006a, Kleefstra et al 2009]. EHMT1基因失活是大多数Kleefstra综合征的主要特征。

Kleefstra综合征由以下两种机制中任一种导致:

  • 9q34.3微缺失可以解释75%的病例。Yatsenko等分析了28例9q34.3微缺失的无亲缘关系个体后,将该综合征分成三类。[ Yatsenko et al 2009]:
    • 50%是真实的自发性末端缺失
    • 25%为区域内部缺失
    • 25%为复杂的染色体重排或衍生的染色体
  • EHMT1基因的致病性变异可以解释25%的病例。

分子检测包括基因组分析,EHMT1基因的微缺失/重复分析,以及EHMT1基因序列分析。

基因组分析. 因为Kleefstra综合征具有复杂的临床表现,目前主要的病例(~70%)都是通过全基因组缺失/重复检测的方法确定的。基因芯片(CMA)可以检测到先证者的缺失。基因芯片能检测到的缺失的大小依赖于芯片的种类和 9q34.3区域探针的密度。

EHMT1基因的微缺失/重复分析. 约5%的Kleefstra综合征患者由 EHMT1基因内部的缺失导致,用于检测单个外显子缺失或重复的方法(如多重连接依赖性探针扩增[MLPA],qPCR和靶基因CMA)可以检测这部分病人。这些方法可以用于一些由于太小而无法被基因芯片检测到的非基因内缺失(如包含C90RF37基因末端和EHMT1第一号外显子的缺失)的检测。
注意:(1)FISH通常无法确定缺失的大小。(2)常规的染色体分析无法检测到9q34.3微缺失。

EHMT1序列分析.EHMT1基因编码区序列分析可以在25%的先证者中检测到致病性变异。

表1.

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基因 1基因方法该方法可以检出致病性变异的比例2
EHMT1缺失/重复分析 3 (基因组方法)~70%
EHMT1基因的微缺失/重复分析4~5%
序列分析 5~25%
1.

基因及染色体区域和蛋白质相关数据库见表A。

2.

该基因的变异信息见分子遗传。

3.

采用包含该基因或染色体片段的基因芯片(CMA)的方法可以检测到9q34.3 缺失(自发性的末端缺失,复杂的染色体重排或衍生染色体)。

4.

靶基因的微缺失/重复分析可检测EHMT1基因的缺失或重复。一些常用的方法有:定量PCR,长片段PCR,多重连接依赖性探针扩增(MLPA)和专门设计检测目的基因单个外显子缺失或重复的芯片。

5.

序列分析检测的变异是良性的,可能良性的,意义不明的,可能致病性的或致病性的。致病性的变异包括基因内的微小缺失/插入,错义变异,无义变异和剪接变异。通常无法检测到外显子或整个基因的缺失/重复。想要了解序列分析结果的相关问题,请点击。

 

临床特征

临床描述

Kleefstra综合征在临床上可辨认的表现包括体格,发育和行为特征。男女同样受累。[ Stewart et al 2004, Yatsenko et al 2005, Kleefstra et al 2006b, Stewart & Kleefstra 2007, Kleefstra et al 2009, Willemsen et al 2012].
出生体重通常是正常或正常偏上; 在儿童时期,体重增加会导致肥胖(50%)。 [Cormier-Daire et al 2003, Kleefstra et al 2009, Willemsen et al 2012]. 面部特征包括短(小)头畸形、宽前额、连眉、眉毛形态不正常(拱形或直线)、轻度的上斜睑裂、面中部后缩、耳轮增厚、鼻孔前翻的短鼻、下唇肉质唇红外翻和 夸张的丘比特唇弓或帐篷状上唇,舌头过长和凸颌。(图1, 图2).

Figure 1. . Photographs of affected individuals showing the characteristic facial profile comprising brachycephaly, widely spaced eyes, synophrys/arched eyebrows, midfaceretrusion, protruding tongue, eversion of the vermilion of the lower lip, and prognathism of chin.

图1.

这些图片显示患者的面部特征:短头畸形、宽眼距、一字眉或拱形眉毛、面中部后缩、过长的舌头、下唇唇红外翻和凸颌(更多……)

Figure 2. . Photographs of affected individuals showing the characteristic facial profile comprising brachycephaly, widely spaced eyes, synophrys/arched eyebrows, midface retrusion, protruding tongue, eversion of the vermilion of the lower lip, and prognathism of the chin.

Figure 2.

这些图片显示患者的面部特征:短头畸形、宽眼距、一字眉或拱形眉毛、面中部后缩、过长的舌头、下唇唇红外翻和凸颌(更多……)

随着年龄的增长,患者的面部变的更加粗糙,面中部后缩和凸颌保持不变。牙齿的异常越来越明显,尤其是可以看到初生的牙齿及乳牙存留。
Kleefstra综合征患者表现出一系列认知和适应性问题,尽管有部分个体仅仅有轻微的智力落后(总的IQ约为70),但绝大多数个体都有中度或重度的 智力落后。大部分病人都有严重的语言表达发育迟缓,而其一般的语言发育处于较高的水平。因此,对于许多患者来说,手语或者象形文字的使用是很有意义的。
由于儿童期肌张力低下,病人的运动发育是受到损害的。但几乎所有的病人在2到3岁后都能独立行走。
在相当一部分的Kleefstra综合征患者中可以看到先天性缺陷。50%的患者有(圆锥动脉干)心脏病。已报道的心脏相关疾病有ASD/VSD、法洛四联症、主动脉狭窄、主动脉瓣闭锁和肺动脉狭窄。许多患者有心房扑动。
10%-30%的病人存在肾脏疾病,包括膀胱输尿管反流(VUR)、肾积水、肾囊肿、慢性肾功能不全。
30%的男性有生殖方面的缺陷,如尿道下裂、隐睾和小阴茎。有些病人有马蹄内翻足。其他已经被报道的异常包括腹壁疝、气管/支气管软化合并呼吸困难以及胃食管反流。
30%的病人有癫痫发作,包括强直-阵挛发作、失神发作和复杂的部分性癫痫。
除了社会行为问题,在儿童早期时,病人有睡眠障碍、刻板行为、轻度自残和孤独症。有报道发现一些青少年和成年人存在极端冷漠和紧张症(样)的行为   [Verhoeven et al 2010].  睡眠障碍的特点是在夜间和清晨频繁地觉醒,而在白天过度的清醒,可以与史密斯-马吉利综合征的睡眠障碍进行对比。
目前没有明确的数据表明患者寿命的长短。然而,值得注意的是,心脏病、反复吸入性肺部感染等并发症会导致患者死于婴儿或儿童期。 [Stewart & Kleefstra 2007].

目前研究表明EHMT1(如变异或变异)与9q34.3微(<1 Mb)的病人有着相似的临床症状。而那些携带较大(>1Mb)的患者会有更严重的身体问题。与那些仅仅携带9q34.3微小或EHMT1基 因的的患者相比,携带较大的患者更容易出现肺部感染和呼吸困难。

可能是100%:尽管Kleefstra综合征患者的临床表现在严重程度上存在差异,但EHMT1有一个拷贝时,患者一定会出现Kleefstra综合征的临床特征。

命名

Knight等在端粒FISH研究中首次认识到这个疾病。  [Knight et al 1999, Dawson et al 2002]. 在一个有着类似的患者中检测到一个自发性的平衡,该平衡导致EHMT1功能异常。因此, Kleefstra等推测9q34患者的临床是由EHMT1导致[ Kleefstra et al 2005]. 随后在其他的病人中鉴定出EHMT1,使得OMIM将这种疾病称为Kleefstra综合征。

发病率

目前没有明确的发病率。基于包括智力低下在内的罕见病数据,Kleefstra综合征的人群发病率至少为1/200,000,因为许多的病人尚未得到明确的诊断,所以真实的发病率可能要高得多。
本综合征没有地域和种族的差异。

 

遗传相关(等位基因)的疾病

除本GeneReview所讨论的Kleefstra综合征外,9q34.3内的或者EHMT1不会导致其他的疾病或

鉴别诊断

以下的疾病应与Kleefstra综合征相鉴别:

 

管理

首诊后评估

为了确定疾病的范围和Kleefstra综合征患者的需求,推荐进行以下评估:

  • 所有器官系统的全面检查
  • 体格和神经系统检查
  • 肾脏超声检查评估肾/泌尿系统异常
  • 超声心动图和心电图评估心脏结构性异常和房性心律异常;根据心脏异常的严重程度进行随访。
  • 包括听力检查在内的言语/语言评估
  • 胃食管反流(GER)征象的评估
  • 物理和/或职业治疗疗效评估
  • 睡眠史
  • 脑电图评估癫痫发作
  • 神经影像(MRI)在发现癫痫发作和/或运动障碍、极端冷漠/紧张症、和/或精神运动发育倒退上尤为重要。

症状治疗

治疗方法如下:

  • 由儿科或神经科医生、精神科医生进行常规的儿科护理,和/或由智力低下成年人的护理专家对成年人进行常规护理。
  • 根据患者的年龄,分别进行儿童期早期干预、特殊教育和/或职业培训。
  • 言语/语言治疗、物理和职业治疗以及感觉统合疗法
  • 对具有极端行为问题或运动障碍的患者进行专门的神经或精神方面的治疗。行为疗法包括特殊教育技术(通过强调个性化教学的设计可能对减少在学校期间的行为问题有一定的帮助)、结构和一系列日常事务。
  • 睡眠障碍目前没有很好的治疗方法
  • 对癫痫患者进行专门的神经系统的护理;按照标准程序处理癫痫发作。
  • 按照标准程序治疗心脏、肾脏、泌尿系统和其他临床问题
  • 助听帮助确定听力丧失的病人

监督

应根据需要监测心脏和肾脏/泌尿系统异常。

高危亲属评估

为目的的高危亲属检测等相关问题见

治疗调查

查询ClinicalTrials.gov 可以获得大量疾病及临床状况的临床研究信息。注意:可能没有这个疾病的临床试验。

 

遗传咨询

是向个人和家庭提供遗传疾病的本质、遗传方式及影响以帮助他们作出明智的医疗和个人决策。后续部分包括进行遗传风险评估和使用家族史和遗传检测来明确成员的遗传状态。这部分不意味解决个体可能面对的所有个人、文化或伦理问题,或者代替咨询遗传学专家。—ED.

遗传方式

Kleefstra综合征是一种病,主要由9q34.3微缺失EHMT1基 因的导致。 到目前为止,几乎所有病例的变异都是自发性的。

成员患病风险— 9q34.3 微缺失

9q34.3 微缺失通常是自发的,但当父母亲为复杂的重排或体时,也会遗传给下一代 。

双亲

  • 到目前为止,包含9q34.3区域的不平衡衍生由亲代遗传给子代的情况未见报道。
  • 已有报道显示,父母亲在包含9q34.3区域的存在平衡,该家庭中会出现多个患者。 [Knight et al 1999, Dawson et al 2002].
  • 到目前为止,除了三个家庭外,所有已检测到的9q34.3微缺失都是自发的。三个家庭中的一个存在缺失,第二个家庭有两个严重的患儿,其父母有学习困难的表现,第三个家庭一个患儿,其父母也表现为学习困难。[作者,个人观点]
  • 对于携带9q34.3微缺失患者的无症状父母,推荐采用常规结合FISH技术进行检测,分析其包含9q34.3的片段是否存在平衡性的重排。

同胞

  • 同胞的风险取决于双亲的遗传状态。
  • 如果(不太可能)父母亲是9q34.3微缺失体,或者是包括生殖细胞在内的低水平的体,或者是包含9q34.3区域的结构发生平衡性重排, 同胞的患病风险会增加。风险的评估取决于特异性的重排。

的后代

成员患病风险— EHMT1

几乎所有的EHMT1都是自发的。

双亲

同胞

的后代

相关问题

计划生育

  • 孕前是确定遗传风险以及讨论产前检测可行性的最优时间。
  • 可以向有怀 Kleefstra综合征患儿风险的青壮年提供(包括讨论后代潜在的风险和生殖选择)。

DNA银行用来储存未来可能使用的DNA(主要从白细胞中提取的)。由于方法的测试和我们对变异以及疾病的理解将可能在未来得到完善,因此应该考虑建立受累患者DNA银行。

产前检测

对高危妊娠的胎儿进行产前检测之前,需首先确定是否为9q34.3 微缺失或者EHMT1患者,和/或其父母是否为平衡。因为父母的、包括生殖细胞的平衡会增加下一个孩子的,因此 可以给已生育过一个9q34.3 微缺失或者EHMT1患儿的父母进行

  • 9q34.3 微缺失。 通过在15到18周时的羊膜腔穿刺术或10到12周的绒毛膜穿刺术获取胎儿细胞,制备标本后,采用“诊断”,“建立诊断”中所提到的FISH或MLPA的方法进行分析。

注意:妊娠周期是根据末次月经的第一天开始计算,或者通过超声测量。

植入前诊断是有9q34.3 微缺失或者EHMT1高风险家庭的一种可能选择。

 

资源

GeneReview职员已经选择了如下疾病特异的和/或保护伞支持组织和/或对疾病患者及其家庭有益的登记系统。GeneReview对其他组织提供的信息不负责。关于选择标准信息,点击这里。

  • Chromosome Disorder Outreach (CDO)
    PO Box 724
    Boca Raton FL 33429-0724
    Phone: 561-395-4252 (Family Helpline)
    Email: info@chromodisorder.org
    www.chromodisorder.org
  • Unique: The Rare Chromosome Disorder Support Group
    G1 The Stables
    Station Road West
    Oxted Surrey RH8 9EE
    United Kingdom
    Phone: +44 (0) 1883 723356
    Email: info@rarechromo.org; rarechromo@aol.com
    www.rarechromo.org
 

分子遗传学

分子遗传学信息及OMIM表格可能在GeneReview的某些地方有所不同:表格可能包含更多最近信息。 —ED.

表 A.

Kleefstra 综合征:及数据库

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蛋白质Locus SpecificHGMD
EHMT19q34​.3Histone-lysine N-methyltransferase EHMT1EHMT1 数据库EHMT1
 

数据来源如下:来自HGNC;座、座名、、遗传互补群来自 OMIM;蛋白质来自 UniProt. 对于Locus Specific, HGMD等数据库的链接,点击这里。

表 B.

Kleefstra综合征的OMIM条目 (见OMIM)

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607001常染色质组蛋白甲基转移酶1; EHMT1
610253KLEEFSTRA 综合征

结构。 最早确定的EHMT1转录本 (NM_024757.3)包含26个,转录起始定位于2号。后来的升级版(NM_024757.4) 在5' 端增加了一个。最新的开放阅读框由27个编码成。转录起始定位于新的1号上,比之前的ATG起始提前了97.6kb。目前的诊断 性检测直接针对EHMT1 NM_024757.3序列的25个进行。因为有三个Kleefstra综合征患者的9q微区域除了包括近端几个外,只包含了新的 EHMT1序列,[作者,个人观点],因此,常规的诊断性检测应该针对新的转录本进行检测。与蛋白质的详细信息见表A。

致 病性变异。 EHMT1变异类型包括变异、变异和变异,以及微小(表 2) [Kleefstra et al 2006a, Kleefstra et al 2009, Willemsen et al 2012]. 注意:变异的名称已经按照NM_024757.4的序列进行校正。

Table 2.

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DNA 碱基改变
(别名) 1
预测的氨基酸改变参考序列
c.871C>Tp.Arg291TerNM_024757​.4
NP_079033​.4
c.1413_1425delp.Pro473GlnfsTer86
c.1533_1536delp.Asp512AlafsTer50
c.1810C>Tp.Gln604Ter
c.1858C>Tp.Arg620Ter
c.2028dupp.Pro677AlafsTer21
c.2193-1G>Cp.?
c.2863_2864delGTp.Val955ArgfsTer221
c.2868-1G>Ar.spl?
c.2877_2880delTTCT (2878_2881del)p.Ser960GlyfsTer7
c.3181-80_3233delr.spl? 2
c.3180+1G>Tr.spl?
c.3218G>Ap.Cys1073Tyr
c.3229C>Tp.Gln1077Ter
c.3502C>Tp.Arg1168Ter
c.3589C>Tp.Arg1197Trp
 

变异分类的注意事项:表中的变异由作者提供,GeneReviews 工作人员未单独进行分类。

 

命名注意事项:GeneReviews 以HGVS (varnomen​.hgvs.org)命名规则为依据。命名的详细信息见快速索引。

 

p.? 表示尚未分析蛋白质的改变,预期有功能效应,但难以得到预测。

 

r.spl? 指定变异可能影响


1.

变异名称不符合当前的命名规则。

2.

供体

正 常的。NM_024757.4转录本编码一个1298个氨基酸残基的蛋白质。EHMT1基 因编码常染色质组蛋白甲基转移酶1。DNA缠绕在组蛋白上,而组蛋白尾巴部分在染色质的折叠中起重要的作用。这些组蛋白尾巴的可能调控染色质的折 叠过程,从而改变介导转录的蛋白与DNA的靠近。[Martin & Zhang 2005]. EHMT1 在小鼠大脑中的限制性表达(嗅球、上/腹侧脑室壁、海马、和梨状皮质)支持其在大脑正常发育中的表观遗传学的组蛋白修饰中发挥作用。 [Kleefstra et al 2005].

异 常的EHMT1或一个引起效应,导致 Kleefstra 综合征。 EHMT1主要的会扰乱开放阅读框,推测会导致介导的降解。到目前为止,已被报道的一个致病性变异可能影响EHMT1蛋白pre-SET的局 部构象,从而导致一个。[Kleefstra et al 2009]. 除了 EHMT1,其他与智力低下相关的(如MECP2、RSK2和XNP)也在染色质重塑中发挥作用。 [Ausió et al 2003]. 染色质结构调控的丧失可导致转录和蛋白质表达的异常,从而导致包括智力低下在内的复杂性遗传病。

 

参考文献

引用的文献

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Chapter Notes

Revision History

  • 7 May 2015 (me) Comprehensive update posted live
  • 5 October 2010 (me) Review posted live
  • 28 May 2010 (tk) Original submission