【初稿】 16p12.2 微缺失

16p12.2 Microdeletion

16p12.1 Microdeletion
英文原文链接

, MBBS, PhD, , MD, MS, and , MS.

Author Information

翻译者:苏家荪,沈亦平

Initial Posting: 2017-09-01 11:51:55; Last Update: 2017-12-05 08:01:10.

概要

临床特征:

16p12.2微由于临床症状的异质性,尚不构成一种被公认的综合征。需要注意的是,对通过微阵列分析(即,智力障碍和 发育迟缓的儿童;精神分裂患者)患者评估的明显偏差使得建立特定的与16p12.2微的关系很困难。该 在儿童()中常见的症状包括:发育迟缓, 认知障碍(轻度到重度),生长障碍(包括身材矮小),心脏异常,癫痫,精神病和/或行为困难。其他的临床症状还包括:听力,牙齿异常,肾脏及生殖系统(见于男性)异常,唇/腭裂。

诊断/检测

16p12.2微诊断的确立是通过CMA或者其他 组分析方法证明在 16p12.2存在520Kb的 杂合性

管理

临床症状的治疗:对直接的临床症状采取治疗措施,包含发育迟缓的治疗;心脏病、癫痫、精神病和行为困难、听力,及其他异常(如唇/腭裂;肾脏异常,生殖器异常及牙齿异常)的常规治疗。

  监测:定期随访:发育评价;对心脏,肾脏,泌尿系统,牙齿异常进行监测。由临床遗传学家进行重新评估。

 

16p12.2微的遗传方式为 显性。大部分(约95%)携带该的患者遗传自双亲之一(可有或没有与该微相关的临床表现)。如果双亲之一为16p12.2 杂合性同胞遗传该微的风险为50%;但是,由于该微降低,同胞风险小于50%。如果在一个家庭成员中发现有16p12.2微,则可能需对有风险的孕妇行;但不能根据16p12.2微的实验室检测结果去预测

 

诊断

16p12.2微还没建立正式的临床诊断标准

由于16p12.2微临床的异质性,16p12.2微的诊断通过微阵列分析(CMA)或其他组分析方法检测建立。

提示性症状

 提示可能为16p12.2微的临床症状包括:

  • 发育迟缓
  • 轻到中度的智力障碍
  • 语言发育迟缓的
  •  精神及行为异常,包括狂躁症,抑郁症及精神分裂
  • 没有固定模式 轻度 异形面容。
  • 先天性心脏病
  •  睡眠紊乱
  •  癫痫
  • 有学习困难或者精神问题的家族史

诊断的确立

16p12.2微诊断的确立是发现在 16p12.2存在520Kb的 杂合性(见 表1分子遗传学)

复发性16p12.2微为包含7个已注释或者转录本的片段的(见 分子遗传学)。该复发性位于包含6个片段性(定义为(大于1Kb)且一致性大于90%的序列)的侧翼(见 分子遗传学)。目前尚未清楚16p12.2微中的是如何引起临床

16p12.2微可通过全组或者是针对区域序列拷贝数的靶向 分析方法来检测

表1.

 16p12.2微方法汇总

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检测方法该方法检测出携带比例
/ 分析 1 520Kb 大小的 2探针合适情况下约为100% 3
1.

鉴定对 或全 /,不能通过编码及侧翼 区的 来检测,但可以其他使用多种方法分析,如: ,长片段PCR,多重链接-依赖探针扩增(MLPA)及包含该/片段的微阵列芯片(CMA)

2.

的坐标为16号~21,950,000-22470,000的位置(组版本为 UCSChg19/NCBI37) (见 分子遗传学命名法).

3.

根据该原初的检测方法决定是否需要另一种独立的方法验证该。该的检测应用的是高分辨的微阵列分析平台,则没必要对该进行验证,原因是不可能偶然出现大于50-100相邻拷贝数区域的异常。

 

临床特征

临床症状描述

 由于16p12.2微表现度的异质性,在 微阵列分析应用于遗传学诊断之前该变异还不被认知。在评价那些的通过微阵列分析的智力障碍和发育迟缓[ Girirajan et al 2010, Cooper et al 2011] 及精神分裂的患儿时,较大的偏差使得建立精确的与16p12.2微的关系很困难( Table 2)。

表 2.

16p12.2微的临床

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症状Frequency 频率%
发育迟缓19/2095%
语言发育迟缓15/1788%
颅面骨异常23/2688%
生长迟滞9/2241%
小头畸形7/2232%
先天性心脏病8/2433%
癫痫8/2532%
精神/行为异常9/1656%
听力3/1817%
肌张力降低10/2245%
骶骨窝或脊髓栓系4/2417%
 de Jong et al [2010], Girirajan et al [2010], D'Alessandro et al [2014], Rai & Sharif [2015]    某些可能还会有其他一些与相关的遗传学异常;因此发生的频率可能表现出偏差。
 

上述来源于一项对23个非亲关系的16p12.2微的临床遗传学队列研究得出的结果[ Girirajan et al 2010].,群体的差异性可能会使某些产生偏差。

发育迟缓Girirajan 等人 [2010] 报道,所有16p12.2微的患者都表现出轻至重度的发育迟缓。所有大于12月龄的患者表现出语言发育延迟;某些患者在儿童期或青春期仍存在语言困难。运动发育也受影响,很多患者有全面发育迟缓的问题。

然而,有报道发现患有心脏病的该患者中并不表现出发育迟缓[ D'Alessandro et al 2014],也有的报道携带该微的1岁孩童早期语言发育正常[ Rai & Sharif 2015].

认知障碍.Girirajan 等人 [2010] 描述了16p12.2微患者认知障碍的谱系范围,可从一个正常的双亲至轻度到重度患者。携带该微的父母更可能表现出学习困难。

特殊面容.Girirajan等人报道很多16p12.2微患者有 特殊面容, 但是没有统一的表现  [ Girirajan et al 2010].

生长.大约2/5的儿科患者伴有发育倒退,3/5有身材矮小[ Girirajan et al 2010].

另一个16p12.2微患者表现低出生体重和身长 [ Rai & Sharif 2015]

在22个16p12.2微儿科患者中有7个患者表现出小头畸形,其中两个有正常的生长参数 [ de Jong et al 2010, Girirajan et al 2010, Rai & Sharif 2015].。

心脏病.16p12.2微可能是心脏病的高风险因素,不是所有的16p12.2微患者都会做心电图检测,8个患儿伴有心脏病,其中4个有左心发育不全(2个患者伴),室间隔缺损,卵圆孔未闭,心包后缺如,二叶主动脉瓣, 动脉导管未闭,法洛四联症伴肺动脉瓣[ Girirajan et al 2010, D'Alessandro et al 2014].。但16p12.2微不会是左心病变的主要病因。

癫痫。约1/3 16p12.2微患有癫痫和/或脑电图异常。癫痫的类型包括West综合征,失神性发作,肌阵挛性癫痫,高热惊厥[ Girirajan et al 2010]

精神及行为问题.在对16个16p12.2微患者的评估中,超过一半(9/16)的患者表现出精神 和/或行为问题。3个患者表现出自闭症或刻板行为,3个患者表现出注意力缺陷,2个患者表现出攻击行为 [ Girirajan et al 2010].。

也有报道发现16p12.2微在精神分裂人群中较为集中,与对照人群的优势比为2.72(95%的可信区间为,1.48-5.02)[ Rees et al 2014].此外,在对照人群中回顾性分析中发现,一名诊断为抑郁症患者携带有16p12.2微。携带16p12.2微的父母更有可能发生轻度学习障碍或者精神问题,如抑郁,躁郁症[ Girirajan et al 2010].。

其他神经问题.在3名患者中发现听力:2名为单侧听力,1名为双侧听力;2名为神经性听力[ Girirajan et al 2010].。

在10/22名患者中发现有肌张力减低[ Girirajan et al 2010, Rai & Sharif 2015].

在24名患者中发现有骶骨窝或脊髓栓系。[ de Jong et al 2010, Girirajan et al 2010, D'Alessandro et al 2014, Rai & Sharif 2015].

在8个患者中发现有5个患者表现出脑影像异常,包括小脑发育不良,脑白质减少,脑室非特异性改变,胼胝体发育不全 [ Girirajan et al 2010].

1名16p12.2微患者由于颈髓椎管狭窄引起产后脑积水发作[ Rai & Sharif 2015],亦有1名先天性脑积水的患者的患者报道[ Girirajan et al 2010].

其他先天性异常.除了心脏病,其他先天性异常偶见报道。某些异常可能由其他未知的遗传因素引起[ de Jong et al 2010, Girirajan et al 2010, D'Alessandro et al 2014, Rai & Sharif 2015]:。

 
  • 4名患儿有尖牙,伴有双侧切牙 ,钉状切牙,牙齿拥挤,及/或龋齿。
  • 3名患儿有肾脏异常(小肾脏,马蹄肾,肾积水)
  • 3名男性患者有生殖系统异常,包括阴茎下曲,尿道下裂,隐睾[ Girirajan et al 2010, de Jong et al 2010].
  •  2名患者有腭裂,1名伴有唇裂
  • 两名患者有马蹄内翻足或者脚弯曲。
  • 1名16p12.2患者表现为颅缝早闭,腹股沟疝,气道发育不全,但该名患者还携带另一罕见的[ Girirajan et al 2010, de Jong et al 2010]。

 -表现型关联

携带16p12.2微比对照人群更可能发生第二种罕见非相关且大于500kb的 (CNV)[ Girirajan et al 2010, Girirajan et al 2012]. 这些患者的比单纯携带第二种致病性CNV的患者更严重,提示16p12.2微是引起神经发育的一种独立的风险因子[ Girirajan et al 2010].

16p12.2微不全。

文献资料显示通过微阵列分析技术发现,16p12.2微在精神分裂患者人群中较为集中 [ Girirajan et al 2010, Cooper et al 2011] [ Rees et al 2014].。随后的研究也发现在正常的父母及对照人群中也携带该微。通过随访发现,携带该微的患者双亲更有可能发生癫痫,轻度智力障碍,及精神问题,提示16p12.2微是异常神经发育障碍表现的风险因素,具有不全的及不同的表现度。

根据对16p12.2微患儿及成人对照的分析评估,智力障碍/发育迟缓及/或先天性异常的比例为12.3%(95%可信区间,7.91-18.8%) [ Rosenfeld et al 2013]和13%(95%可信区间,5.7%-30%)[ Kirov et al 2014]。

Kirov et al [2014] 评估16p12.2微患者精神分裂的 为3.1%(95%可信区间,1.2%-8.3%) 。

另外 ,16p12.2更有可能具有神经精神的家族史,提示存在 现象。值得注意的是,在42名16p12.2微患者中发现10名患者同时携带另一种大片段(大于500Kb)组CNV。“二次打击”常见于 新发突变 或者从不携带16p12.2微的父母传递下来。这些发现提示该微有神经精神的风险,其及表现度由第二种与相关的大片段CNV或者潜在的组其他修饰决定。

与携带综合征型CNVs(如 Smith-Magenis 综合征,患者男性约占50%)人群相比较,那些降低及表现度可变的CNV(类似16p12.2微)在男性中出现比例会更高,提示16p12.2微在男性中的可能比女性更高 [ Girirajan et al 2012, Jacquemont et al 2014]。

现象

虽然所有的报道描述了16p12.2微患者比携带同样的父母更严重,但这更可能是一种评价的偏差,而不是遗传学 期现象。没有报道表明传递的16p12.2微会发生片段大小的改变。

命名

最开始被描述的位置为16p12.1(坐标为~21,850,000-~22,370,000,组版本hg18/NCB136), 改为16p12.2(坐标为~21,950,000-~22,470,000,组版本hg19/GRCh37)。目前的临床报告和描述使用 16p12.2命名。

发病率

16p12.2微的发病率-通过微阵列检测分析患者的发病率约为0.19%[ Rosenfeld et al 2013]-与 Smith-Magenis 综合征相似,提示Smith-Magenis 综合征及有一种异常的16p12.2微在新生儿中可能的发病率相似,大约为1:15000 [ Girirajan et al 2010].

但是,该发病率并没有把携带该杂合性微的健康或者轻度患者计算在内。

 

相关遗传病

16p12.2 微。在患者人群中为发现该复发性的富集现象 [ Cooper et al 2011],因此可能是

16p11.2-p12.2 微.一种包含16p区域的。常见的包括特殊面容,先天性异常,喂养困难,耳朵感染,先天性和发育迟缓。区域约为7.1Mb,坐标为~21,500,000 to ~28,600,000 ( UCSChg19),包括复发性16p12.2区域 [ Ballif et al 2007, Battaglia et al 2009, Hempel et al 2009, Okamoto et al 2014].

除在 GeneReview讨论的临床症状之外,未发现有与16p12.2 520kb区域内相关的临床

鉴别诊断

16p12.2微缺失的鉴别诊断宽泛,跟许多非综合征型及非典型性发育迟缓/行为异常的诊断一样需要 染色体微阵列分析。

 

管理

初诊后评估

为确定16p12.2微患者的疾病状况和需求,推荐以下评估手段

  • 身高或体重测量
  • 多系统综合性评估
  • 对认知及行为进行测试的发育评估
  • 需考虑:
    • 如家族史提示癫痫发作的可能,则需对神经性及脑电图检测进行咨询。
    • 心脏科专家对心电图的分析和评估

症状治疗

由于16p12.2微的临床症状是可变的,特殊的症状需要对症治疗。早期诊断和治疗会对最好的预后有帮助。建议根据不同的症状安排相应的医学专家会诊,包括儿科发育/行为学专家,儿科神经学专家,及医学遗传学专家。

发育迟缓及认知障碍。发育迟缓治疗从症状提示时立即进行。对年龄稍大的儿童进行认知测试,不仅可帮助鉴定出特殊学习困难或者认知障碍,也可帮助制定特殊教育计划及治疗。

心脏异常.对心脏异常的16p12.2患者,需对症状进行标准化处理,包括外科纠正及抗生素治疗。

癫痫发作.家族史提示癫痫发作的可能,需及时请神经学专家咨询评估,包括脑电图显影检测及采取医疗干预措施。

精神及/或行为困难。对任何年龄段的患者,出现精神或行为困难需要及时咨询专家,包括儿科发育/行为学专家,神经学专家,以便采取正规的评估和采取相应的干预。

听力。需提供对听力的标准化治疗。 见遗传性听力和耳聋.

其他症状。需提供对口腔颌面裂、肾脏、生殖系统及牙科等任何一种症状进行标准化治疗。

监测

 定期随访

  • 由于发育迟缓、智力障碍、孤独症谱系障碍、及其他行为异常的发病率逐渐增加,需对患者发育情况进行评估。
  • 如需要,对心脏、肾脏、泌尿系统及牙科异常进行监测。
  • 医学遗传学家重新评估,给予患者家属新的医学检测指导或者精神健康关注。

亲属患病风险评估

中有关该疾病亲属患病风险的评估。

在研的治疗方法

可通过搜索ClinicalTrials.gov获取各种疾病临床试验的信息。注:该疾病可能没有临床试验。

 

遗传咨询

遗 传咨询的内容是向患者及其家庭提供该病的性质、遗传方式及其可能造成的影响方面的信息,使他们在充足的知识及信息帮助下做出基于足够背景知识,以及符合个 人情况的医学选择或个人决定。 以下段落涉及的是如何根据家庭成员的遗传状况、家族史、及遗传学检测结果对家庭成员进行遗传风险评估。这部分目的不是为了解决所有患者所可能面临的个人、 文化、或伦理问题,也不能代替遗传学专业远远的咨询工作- ED

   

16p12.2微的遗传方式为常显性。

家庭成员的患病风险

父母

注:生殖腺 , 及包含16p12.2区域的平衡性重排尚未见报道。

的同胞

  • 同胞的风险取决于父母的遗传状态。
  •  如果父母一方为16p12.2微,则同胞遗传该微的风险为50%;由于 降低,同胞 受累的风险小于50%。
    •  
    • 携带该微的父母神经精神症状的表现可能提示该家庭的 较高;但不能作为预测同胞表现度的可靠预测。

O 的后代

其他家庭成员。其他家庭成员患病风险取决于 父母的遗传状态:如果父母一方携带16p12.2微,则家庭成员当中也可会出现16p12.2微

R的相关问题

 家庭计划

  • 孕前是遗传风险评估和产前检查可行性分析的最佳时间。同样,对无症状家庭成员遗传风险的评估及检测选择的最佳时机也是孕前。
  •  
  • 为16p12.2微高风险患者提供 是合适的 (包含后代患病风险的评估及生育选择)

DNA样本库考虑到方法学的发展及对、等位突变,及疾病的逐渐认识,受累患者的DNA应当保存至样本库以备将来的应用(一般从外周血白细胞中提取)。

 产前检测及胚胎植入前遗传学诊断

如果在一个 受累的家庭成员中检测出16p12.2微,对有风险的孕妇行产前检测及 胚胎植入前遗传学诊断 是可行的。然而,不能依据实验室发现来对 进行可靠地预测

 

资源

GeneReviews的员工已经为患者选择了针对该疾病的患者支持组织和患者注册组织,目的是利于该疾病患者及患者家庭,GeneReviews不为其他组织提供的信息承担责任。获取选择标准的更多信息,请点击这里

  GeneReviews的员工未发现16p12.2微的其他信息。

 

分子遗传学

 

在分子生物学和OMIM表格内的信息可能和GeneReview里其他地方的信息不一致:表格可能包含最新的信息-ED。

表A。

16p12.2微和数据库

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位置蛋白质
未提供16p12 ​.2   16p12.2 未提供
从以下标准化的参考资料中整合数据:来自HGNC位置、位置名称、互补群信息来自OMIM; 蛋白信息来自UniProt. 关于数据库的描述(特异,HGMD),点击这里. :

 表B

OMIM中收录的16p12.2微词条(浏览 OMIM

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136570CHROMOSOME 16p12.1 DELETION SYNDROME, 520-KB
  13657016p12.2,520-Kb

分子遗传发病机制

16p12.2区域520-kb微(坐标:~21,950,000-~22,470,000, UCSChg19/GRCh37)包含了7个  : UQCRC2, PDZD9, C16ORF52, VWA3A, EEF2K, POLR3E, 及 CDR2(RefSeq ,UCSC hg19/GRCh37)。上述一种或者多种是否会导致临床症状还未清楚,需要注意的是,该区域相邻区域是包含6个其他的片段性性序列密度大于90%的大于1kb的区域)

16p12.2微是由侧翼密度大于95%的68-kb低拷贝片段介导的重排[ Antonacci et al 2010, Girirajan et al 2010]。根据片段的数量和定位,在普通人群中常见两种单倍型[ Antonacci et al 2010]. S2型在16p12.2微区域侧翼有68-kb的片段,提示S2型更接近于复发性16p12.2微。与该假设一致的是 ,S2型在16p12.2微人群中有富集现象。人群中S2的频率非洲人群中为(97.5%),欧洲(83.1%),亚洲(71.6%)。因此,非洲人 群有着比亚洲人群更高的16p12.2微的患病风险[ Antonacci et al 2010]。

16号着丝粒区有较多可介导复发性微的片段性,16p12.2微特指坐标为~21,850,000-~22,370,000 (16p12.1, UCSC hg18/NCBI36) 或者 ~21,950,000-~22,470,000 (UCSC hg19/GRCh37)的片段

 

参考文献

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章节注释

 作者

Santhosh Girirajan  实验室

我对认识智力障碍、发育迟缓,孤独症,精神分裂及癫痫等人类精神发育疾病相关的基因组结构、功能对应的病因学及功能感兴趣。对Smith-Magenis 综合征(SMS)的研究工作使我认识到,维甲酸诱导1(RAI1)缺失的所有个体示是如何表现出不同的临床表型[ Girirajan et al 2005, Girirajan et al 2006].进一步,对模型鼠的研究证实了RAI1在SMS中的作用[ Girirajan et al 2008, Girirajan & Elsea 2009a, Girirajan & Elsea 2009b]。作为Evan Eichler 实验室的一名博士后,我参与了研究那些致病基因未知且携带同样的缺失或但表现出宽泛临床表型的个体CNVs。对基因组有害的第二种变异可以解释表型的可变。与16p12.1缺失的最初描述一样[ Girirajan et al 2010],“二次打击”模型同样可以解释表型异质性的CNVs,如16p11.2缺失,15q13.3缺失,17q12缺失,15q11.2缺失,1q21.1缺失[ Girirajan et al 2012]。

修改历史

  • 2015年 2月26 日 公布前审阅
  • 2014年 9月9日 初次提交