【初稿】 9q22.3微缺失

9q22.3 Microdeletion

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翻译者:胡旭昀,沈亦平

Initial Posting: 2017-09-01 11:51:55; Last Update: 2017-12-05 08:00:04.

摘要

临床特征.

9q22.3微,包括 PTCH1, 该是Gorlin综合征(痣基底细胞癌综合征)中突变的,该疾病已详细的描述,可根据临床发现进行断定,以及发育迟缓和/或智力障碍,特应性颅缝 管狭窄,阻塞性脑积水,出生前和出生后的巨大儿以及癫痫。受累个体Wilms肿瘤的风险增加。 Gorlin综合征的常见表现包括:20岁以前的大脑镰 钙化、皮肤基底细胞癌(BCC)、下颌角膜囊肿、手掌/脚底皮肤凹痕 、儿童成神经管细胞瘤以及心脏和卵巢纤维瘤的风险增加。9q22.3微的临床谱是可变的,临床发现在某种程度上取决于微的大小。

诊断/检查.

9q22.3微的诊断通过9q22.3上的杂合来证实。受影响个体(但不在对照组)中通常的最小临界区域为352 kb,包括 PTCH1和 FANCC。通过常规G带分析或其他常规细胞遗传学条带技术不能鉴定出9q22.3微,除非是极大的

管理.

对症治疗:常规治疗和管理是根据心脏,神经和皮肤表现由适当的专家进行。需要全面的体格、职业和言语治疗服务。切除或治疗下颌角膜囊肿、基底细胞癌或其他肿瘤需要术干预。

预防主要表现:限制暴露于电离辐射,如计算机断层扫描和X射线。

监护:通过神经病学家和/或神经外科医生随时监测整个儿童的头围和 神经状态,及时评估脑部大小、行为变化或意识改变,这是障碍性脑积水、成神经管细胞瘤和/或其他脑肿瘤的证据。与Beckwith-Wiedemann综 合征的监测相似,推荐用常规腹部超声波诊断Wilms肿瘤。八岁以上,至少每年皮肤检查,每12-18个月用曲面断层照相片确定颌骨角化囊肿。

因子/环境避免:阳光照射过度;使用放射治疗,因为在治疗区域有发展多个BCC的风险。

妊娠管理:对于具有大头畸形的受累胎儿,可能需要进行剖腹产。

.

9q22.3微是以常显性方式遗传的。在大多数个体 中,微似乎是由新发事件或由平衡重排的父母遗传来的不平衡重排引起的;然而,的遗传自有症状的体母亲的也有报道。当父母双方没 有平衡重排或时,未来怀孕的复发风险很低(大概<5%),但大于一般人群,因为父母可能具有或包括生殖腺的低水平体细胞镶嵌。 基于父母中鉴定的平衡重排或,以及关的可能性,可以对高风险的怀孕进行产前检测。

 

诊断

临床诊断

9q22.3微的临床谱是可变的,临床发现在某种程度上取决于微的大小。

所有报告的 9q22.3 微都包括 PTCH1,该突变导致格林综合征 (痣样基底细胞癌综合征);因此,9q22.3 的个体都有这个已经充分描述的疾病的临床表现 [ Kimonis et al 2004]。

格林综合征的主要特征包括 :

  • 20岁以前的大脑镰 钙化
  • 一生有五个以上的基底细胞癌或三十岁以前有一个基底细胞癌
  • 下颌角膜囊肿
  • 手掌/脚底皮肤凹痕
  • 有格林综合征

格林综合征的次要特征包括 [ Kimonis et al 2004]:

  • 唇裂和/或腭裂
  • 近端或远端多指趾畸形
  • 大头畸形 (枕-额周长>97th百分位)
  • 眼睛异常(包括小眼睛,白内障,视网膜异常,发育缺陷)
  • 肋骨和/或椎骨异常
  • 心脏和卵巢纤维瘤
  • 儿童成神经管细胞瘤(也称为原始神经外胚层肿瘤[PNET])
  • 淋巴肉瘤或胸膜囊肿

其他9q22.3 微的常见表现包括 [ Muller et al 2012]:

  • 发育迟缓和/或智力障碍
  • 短鼻子和长人中
  • 额侧的颅缝早闭
  • 阻塞性脑积水
  • 产前/产后身高体重大于95th百分位
  • 癫痫

9q22.3微的罕见异常可能包括肾脏异常,Wilms肿瘤,Chiari畸形和胼胝体发育不良。

检查

细胞遗传学检查.通过常规G带分析或其他常规细胞遗传学条带技术不能鉴定出9q22.3微,除非是极大的

分子遗传学检查

.9q22.3微的诊断通过9q22.3上的杂合来证实。受影响个体(但不在对照组)中通常的最小临界区域为352 kb,包括 PTCH1(human homolog 1 of Drosophila Patched) 和 FANCC1(Fanconi anemia complementation group C) [ Muller et al 2012]。

.PTCH1的删除是导致9q22.3微的大部分特征的唯一的;然而,该似乎不足以引起与Gorlin综合征中通常观察到的特征不同的特征。在连续 的间隔内包括的两个至273个中是编码微小RNA的,,未识别的开放阅读框和未知功能蛋白的 [ Muller et al 2012]。 这些中的许多,其单个或突变仍然没有明确。

注意:被删除的随着微的大小和断点变化而变化。

临床检查

表 1.

9q22.3微所用分子诊断总结

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区域实验方法检测到的突变 1该方法的突变监测频率 2
9q22.3微阵列 (CMA)  3352 kb到20.5 Mb的有合适的BACs, SNPs, 或寡核苷酸:>99%
4, 5有合适的探针:>99%
 
 

2. 该检查方法用于检测指定的能力

 

3. 使用BAC、寡核苷酸、 SNP或其组合的阵列的微阵列(CMA)可以检测到352-kb最小临界以及更大的。确定涉及352-kb临界区的能力取决于所使用的 微阵列的类型和9q22.3区域中探针的密度。注意:根据分辨率,2008年之前使用的一些微阵列可能未能有效检测该

 

4. 识别/的检查;可以使用多种方法,包括,长片段PCR,多重连接探针扩增技术(MLPA)或靶向微阵列分析(/片段特异性)。

 

5. 如果临床上怀疑该,可考虑临床(FISH)。但是的大小不能由单个FISH探针 确定。

检测结果解释

  • 分析.根据鉴定的初步检查,可能需要通过独立方法确认。如果高密度组芯片平台已被用于鉴定,则可能不需要额外确认,因为许多相邻探针不可能同时偶然地显示异常拷贝数。

诊断策略

确认/建立诊断 要求检测到 最小临界352 kb ,该常见于 9q22.3 微或任何重叠的较大

  • 如果临床上怀疑有 9q22.3 微,可以采用有针对性的技术检测(如FISH、 MLPA)。
  • 可能还会由芯片 (CMA) 检测分析到的,这是作为评价的发育迟缓或智力残疾,和/或整个 PTCH1 检测的一部分执行。

注意: 不能通过常规分析识别。

 

临床特点

临床描述

许多有 9q22.3 微缺失的患者在婴儿期表现出张力减退,所有的患者都表现出大动作延迟。有较大缺失的个体张力减退可能甚至持续到童年晚期和青春期 [ Shimojima et al 2009, Yamamoto et al 2009, Muller et al 2012]. 有最小缺失的个人可能有大动作延迟但没有其他残疾或延迟。

拥有大约 2 Mb 或更大的缺失的个体表现出运动、 语言和行为/社会里程碑的持续延迟 [ Shimojima et al 2009, Muller et al 2012]. 有这些大型的缺失个体通常上学年龄就会显现出来的智力障碍,需要特殊教育。缺失大小增加预计将带来更严重的残疾;有报告称智商或发育商 (DQ) 分数在 40 多到 30 多,或者更低 [ Kroes et al 1994, Redon et al 2006, Fujii et al 2007, Nowakowska et al 2007, Yamamoto et al 2009, Muller et al 2012].

一小部分有9q22.3 基因微缺失的个体发展出癫痫 [ Shimojima et al 2009, Yamamoto et al 2009, Muller et al 2012].

报告称有 9q22.3 基因微缺失的许多 (16/37) 个体有严重到轻度的脑心室扩张,或者无症状,可以与脑萎缩或占位性病变 (例如,髓母细胞瘤)有关 [ Muller et al 2012]. 其中的一小部分 (7/16) 将会有病因不明的严重梗阻性脑积水,需要脑室分流 [ Muller et al 2012].

大约 20%有 9q22.3 基因微缺失的个体有产前发病的巨大儿,出生的长度和重量在第 95 百分位以上并持续到产后 [ Muller et al 2012].

少数病例报告描述9q22.3 微缺失患者的巨大儿或偏侧增生  [ Cajaiba et al 2006, Chen et al 2006, Redon et al 2006, Shimojima et al 2009, Yamamoto et al 2009, Muller et al 2012, Isidor et al 2013].

Eight of the 37 individuals reported and reviewed by Muller et al [2012]描述并回顾的37个病例中的8个表现出额缝提前融合,导致颅缝早闭和三角头畸形。

Cajaiba et al [2006]描述了单独一个人患有肾母细胞瘤和盆腔横纹肌肉瘤并得出结论,虽然肾母细胞瘤与格林综合征是不相关的,但横纹肌肉瘤可能是相关的 [ Cajaiba et al 2006]. 然而,最近报告了四个额外个体有生殖系 9q22.3 基因微缺失与肾母细胞瘤 [ Garavelli et al 2013, Isidor et al 2013]. Isidor et al [2013]从四个受影响的个人中的一个的肿瘤里测序了 PTCH1并证实了一个不是该患者的正常肾组织或血液中存在的非缺失等位基因的体细胞突变。因而,12%(5/42) 的文献报道的有9q22.3 基因微缺失的个体发展出肾母细胞瘤。

受累的个体可能有面部异常,包括宽阔隆起的前额,垂直的额头皱,要么向上或向下的成角的睑裂,一个短鼻子和长人中 [ Ying et al 1982, Farrell et al 1991, Olivieri et al 2003, Midro et al 2004, Redon et al 2006, Nowakowska et al 2007, Yamamoto et al 2009, Muller et al 2012]. 有的个体面部特征随时间愈发明显,然而有的有大缺失的患者一出生特征就很明显 [ Ying et al 1982, Muller et al 2012].

基因型-表型的相关性

许多 9q22.3 微缺失患者中出现的特征源于 PTCH1单倍体剂量不足,并且符合格林综合征。然而,由于迄今为止大多数报道的个体在其缺失内不止PTCH1基因,因此预期这些其他基因中的一种或多种的缺失导致不属于Gorlin综合征的附加表型特征。

Muller et al [2012]确定了10个9q22.3微缺失患者中最小的常见缺失间隔和相关断点,为以下发现:

  • 特应性颅缝管狭窄:含有16个基因的929-kb区域
  • 严重阻塞性脑积水:含有18个基因的1.08-Mb区域
  • 巨大胎儿:一个含有31个基因的1.8Mb区域

注意:这些间隔间的一些基因尚未得到充分验证,没有鉴定出特异性候选基因。

多位作者提出存在于具有9q22.3微缺失突变的个体亚群中的巨噬细胞特异性是丧失父系等位基因的结果 [ Redon et al 2006, Shimojima et al 2009]. 然而,到目前为止没鉴定出缺失区间内有印迹基因。

外显率

预计9q22.3 基因微缺失是完全外显的表型,但表现多样。到目前为止已经有此微缺失但是没有表性的人报道。

患病率

9q22.3微缺陷是罕见的。 迄今为止已有42名受累个体在文献中被报道,其中一名患有体细胞嵌合 [ Yamamoto et al 2009, Muller et al 2012, Garavelli et al 2013, Isidor et al 2013]. 可能在有发育延迟和/或智力障碍且没有其他特征的人群中,9q22.3 微缺失只占很小一部分。

 

遗传相关(等位基因)疾病

有描述过一个母亲和她的孩子包含含有 PTCH1FANCC1号外显子的360kb区域组成的9q22.3重复, 两者均有小头畸形和轻度发育迟缓 [ Derwinska et al 2009].

包括基因内或全基因缺失在内的 PTCH1的显性功能缺失性突变已知导致Gorlin综合征[ Hahn et al 1996].

已经在少数个体中描述了 PTCH1中的显性功能获得性突变与脑膜发育不全7型(OMIM 610828)相关的,表现为与胚胎发生sonic hedgehog蛋白表达降低 [ Ming et al 2002, Ribeiro et al 2006].

在不存在该综合征的任何其他发现的情况下作为单一肿瘤发生的散发性肿瘤(包括成神经管细胞瘤,牙源性角膜囊肿,心脏纤维瘤,卵巢纤维瘤和基底细胞癌)可以是 PTCH1中存在体细胞突变; 因此,这些肿瘤不是遗传性的。 详情请参阅 Cancer and Benign Tumors.

鉴别诊断

一个男性具有轻度异常面部特征,发音困难,漏斗胸和单侧肾发育不全的,鉴定出不包括 PTCH1的5.3Mb的9q22.2-q22.3缺失。 他的两个女儿也出现智力障碍,以及他的异常特征,但没有任何畸形 [ Siggberg et al 2011].

在9q22.3微缺失有多种共同特征的综合征中,Gorlin综合征(痣基底细胞癌综合征)是最常见的。

Beckwith-Wiedemann综合征(BWS)特征为巨大儿症,巨舌,内脏肿大,胚胎性肿瘤(如Wilms肿瘤,肝母细胞瘤,成神经细胞瘤 和横纹肌肉瘤),卵母细胞瘤,新生儿低血糖症,耳朵皱纹/凹陷,肾上腺皮质细胞瘤和肾脏的生长障碍异常(例如,髓质发育不良,肾钙质沉着,髓质海绵肾和肾 脏病)。早期死亡可能发生于早产儿,低血糖症,心肌病,巨大症或肿瘤的并发症。然而,以前报告的20%的死亡率可能是高估的,因为对该疾病更好地认识以及 治疗选择的增加。大黄疸症和巨大儿症通常在出生时出现,但可能出生后发病。七至八岁的增长速度减慢。血红素增生可能会影响身体的部分区域或特定的器官和组 织。分子遗传学检测可以鉴定BWS个体染色体11p15的表观遗传和基因组变化:(1)50%受影响个体的印记中心2(IC2)上母体染色体上甲基化的丧 失; (2)20%的个体染色体11p15的父系单亲二倍体;和(3)5%的个体在印记中心1(IC1)的母体染色体上获得甲基化。 CDKN1C的序列分析鉴定了大约40%的家族性病例和5%-10%无BWS家族史的病例的突变。

Sotos综合征的特点是典型的面部外观,过度生长(身高和/或头围高于平均值≥2SD),学习障碍范围从轻度(儿童上正常学校,成年后可独立) 到严重(可能需要终身护理和支持)。Sotos综合征有行为问题,先天性心脏异常,新生儿黄疸,肾脏异常,脊柱侧凸和癫痫发作的主要特征相关。 约80%-90%的Sotos综合征患者具有 NSD1异常。

许多其他基因组微缺失或微缺失综合征导致9q22.3微缺失相同的表型如发育迟缓或智力障碍和/或一些个体非特异性表型特征。

 

管理

初次诊断后的后续评估

为了确定诊断为微缺失9q22.3的个体的疾病严重程度,建议进行以下评估:

孕期管理

许多具有9q22.3微缺失的个体存在产前发病的巨细胞病和/或大头症。 正如一些人所报道的那样,这可能需要剖腹产,包括紧急情况[ Isidor et al 2013].

在研治疗

搜索ClinicalTrials.gov获取关于各种疾病和病症的临床研究的信息。注意:这种疾病可能没有临床试验

 

遗传咨询

遗 传咨询是向个人和家庭提供关于遗 传疾病的性质,遗传和影响的信息,以帮助他们做出明智的医疗和个人决定的过程。 以下部分涉及遗传风险评估和使用家族史及遗传检测来明确家庭成员的遗传状况的内容。 本节并不意味着能解决患者面临的所有个人,文化或伦理问题,或替代遗传学专业人士的咨询。-ED。

9q22.3微程显性

家庭成员风险

双亲

  • 9q22.3微的父母通常不受影响。
  • 大多数病例是由明显的新发事件或具有平衡异位的父母引起的不平衡重排的遗传所致。
  • 9q22.3微的体细胞/生殖系体在受累个体的无症状父母中没有报道。
  • 已经描述了一个复发性:具有1.7-Mb 9q22.3(包括PTCH1)的状态的女性,和具有以非镶嵌形式的受影响的女儿 [ Isidor et al 2013].
  • 有报道两个中有9q22.3区域的平衡复发 [ Shimkets et al 1996, Midro et al 2004].
  • 对于的无症状父母的评价建议高分辨率分析,以确定是否涉及9q22.3平衡重排是否存在。

兄弟姐妹

  • 同胞的风险取决于父母的遗传状况。
  • 一个的同胞的复发风险很低(大概<5%),但大于普通人群,因为父母可能具有(a)9q22.3微的生殖系,或(b)低水平体细胞镶嵌,也包括生殖系的9q22.3微
  • 如果父母具有涉及9q22.3临界区域的平衡结构重排,则同胞的风险增加,并且取决于具体的重排。
  • 如果父母具有体制性9q22.3微(即,所有父母细胞中存在微量),则同胞遗传微的风险也为50%; 然而并没有这样的报道。

后代. 诊断为典型的9q22.3微的患者中仅有一个人已知可以生殖; 然而,这个人的性的 [ Isidor et al 2013].

其他成员.其他家庭成员的风险取决于父母的遗传状况。 如果父母具有平衡的重排或,则其家庭成员可能也具有重排或的风险。

相关事项

计划生育

  • 确定遗传风险,澄清状态的和产前检测的可行性的最佳时间是在怀孕之前。
  • 应当对受累青年、或有风险的人提供(包括对后代和生殖选择的潜在风险的讨论)。

DNA银行是存储DNA的(通常从白血细胞提取),以备日后使用。因为测试方法和我们对变异和疾病的理解在将来会有所提升,所以受累个体可以考虑保存DNA。

产前检测在技术上是可行的。在妊娠的约15至18周通过羊膜穿刺术或妊娠地约10至12周通过绒毛获得的胎儿细胞获得,可以使用特异性FISH探针分析或微阵列(CMA)以分子遗传学测试。

由于与的可能性会导致一定的复发风险(可能<5%),向具有9q22.3微儿童的父母可提供产前检测。 产前检测也适用于携带平衡重排或具有微的家长。

注意:妊娠年龄表示为从上次正常月经的第一天或超声测量计算的月经周。

植入前遗传学诊断(PGD)可能是9q22.3微的怀孕风险增加的家庭的良好选择。

 

资源

GeneReviews staff has selected the following disease-specific and/or umbrella support organizations and/or registries for the benefit of individuals with this disorder and their families. GeneReviews is not responsible for the information provided by other organizations. For information on selection criteria, click here.

  • Chromosome Disorder Outreach (CDO)
    PO Box 724
    Boca Raton FL 33429-0724
    Phone:561-395-4252 (Family Helpline)
    Email:info@chromodisorder.org
  • Unique: The Rare Chromosome Disorder Support Group
    G1 The Stables
    Station Road West
    Oxted Surrey RH8 9EE
    United Kingdom
    Phone:+44 (0) 1883 723356
    Email:info@rarechromo.org; rarechromo@aol.com
 

分子诊断

Information in the Molecular Genetics and OMIM tables may differ from that elsewhere in the GeneReview: tables may contain more recent information. —ED.

表A.

9q22.3微和数据库

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蛋白质
不适用9q22 ​.3不适用
 

Data are compiled from the following standard references: gene from HGNC; chromosome locus, locus name, critical region, complementation group from OMIM; protein from UniProt. For a description of databases (Locus Specific, HGMD) to which links are provided, click here.

分子遗传病理学

使9q22.3区域易于的机制尚不清楚。 位于 PTCH1和 该区域相邻之间有众多SINE,大型LINE和LTR,潜在地可能易于导致这些事件。 类似地,不清楚在9q22.3微内的(PTCH1除外)删除如何影响,因为在最大报告的20.5Mb的273个中的许功能和 不足仍未得到鉴定 [ Muller et al 2012].

报 告过的受累个体的微大小似乎并不复发。 最早的9q22.3报告先于CMA技术; 在此时只描述了常规细胞遗传条带技术可见的大的,使得与过去几年的报道断点相比较比较困难。 随着CMA技术的发展,报道的最小的9q22.3微只包含两个,PTCH1和FANCC [ Muller et al 2012].

PTCH1 (Drosophila Patched的人类同系物1)编码肿瘤抑制蛋白,是 sonic hedgehog (SHH)蛋白的受体,其以未结合的形式通常用于抑制SHH信号传导。 FANCC(范科尼贫血症互补组C)编码一种蛋白质,是具有E3泛素连接酶活性的核心FA核蛋白复合物的一部分,其在DNA损伤和S期中起作用。 该中的纯合或突变导致范科尼贫血。

Muller et al [2012]在10名9q22.3微个体中,试图定义三种特征性额侧颅缝早闭,阻塞性脑积水和巨大儿症的; 使用这种方法,他们能够将重叠区域缩小到0.929至1.8 Mb。 这些间隔内的公共总结在图1中。

Figure 1.. Schematic of genes involved in ten individuals with 9q22.

图1.

涉及10个具有9q22.3微和共享的个体的示意图,修改Muller et al [2012]

癌症和良性肿瘤

PTCH1中的体细胞突变已经在Gorlin综合征中的癌症中被描述,包括成神经管细胞瘤,牙源性角膜囊肿,心脏和卵巢纤维瘤以及基底细胞癌 [ Kimonis et al 2004].

在具有9q22.3微的个体的Wilms肿瘤组织中,在未删除的上鉴定了 PTCH1中的体细胞突变。 正常肾组织或血液中不存在体细胞突变 [ Isidor et al 2013].

 

参考文献

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Chapter Notes

Revision History

  • 20 February 2014 (me) Comprehensive update posted live
  • 18 August 2011 (me) Review posted live
  • 25 April 2011 (em) Original submission