【初稿】 15q13.3微缺失

15q13.3 Microdeletion

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翻译者:谌飞,沈亦平

Initial Posting: 2017-09-01 11:51:55; Last Update: 2017-12-05 08:00:19.

概要

临床特征。

15q13.3微的个体在广泛的临床(包括智力障碍,癫痫发作,自闭症谱系障碍和精神分裂症)方面有增高的风险;然而,微本身似乎不会导致临床上可识别的综合征,并且一部分具有 的个体并没有明显的临床表现。行为问题相对常见,主要包括注意力不足,多动症,情绪障碍,侵略性和/或冲动行为。在大约一半的这种 复发性的患者中观察到通常为轻度的,但也有可能是中度至重度的智力障碍。

诊断/检测。

15q13.3微被定义为在参考组30.5-32.5Mb的位置存在常见的2.0-Mb的,其中包含1.5Mb的单一序列以及额外的500kb或更多的片段的内没有发现某单个与疾病相关。使用寡核苷酸芯片或SNP芯片的微阵列  (CMA)确定序列拷贝数的组检测方法可检测到中15q13.3的微

管理。

治疗表现:理想的治疗方案是根据患者特定的需求量身定制。针对神经发育障碍的治疗建议在临床心理学家的神经心理和/或发育评估的基础上进行。考虑到患者的年龄和特定的表现,心脏缺陷,癫痫发作,孤独症谱系障碍和精神分裂症的治疗应遵循这些疾病的标准做法。

监测:儿童期建议仔细评估/监测发育指标,如有必要可进行早期介入干预。

遗传咨询.

15q13.3微是以 显性方式遗传的 连续。大约15%是 新发突变,大约85%是遗传获得。具有此的患者的后代有50%的可能性遗传此。虽然产前检测在技术上是可行的,但是根据15q13.3微的实验室发现,不可能可靠的预测其
 

诊断

15q13.3微的患者可能具有广泛的临床表现。 本身可能不会导致可识别的临床综合征,并且一部分具有的个体没有明显的临床表现,这意味着这种存在 外显不全

提示性症状

应在具有以下临床症状的个体中考虑15q13.3微的可能:

  • 智力障碍
  • 言语发育迟缓
  • 癫痫发作
  • 自闭症
  • 精神分裂症
  • 行为问题(注意力不足,多动症,情绪障碍,侵略性和/或冲动行为)

部分受累的患者表现有合并的症状,比如智力障碍和癫痫发作。

建立诊断

1 5q13.3微的诊断是通过检测15q13.3上的2.0-Mb杂合来确定的。

对于这个GeneReview,15q13.3微被定义为在参考组30.5-32.5Mb的位置存在常见的2.0-Mb的,其中包含1.5Mb的单一序列以及额外的500kb或更多的片段的。( NCBI Build [hg38]) 。

注意:这个区域内显著较大或较小可能与15q13.3微在临床上有差异(详见遗传相关性疾病)。

虽然在2.0Mb的区间中有几个值得关注的(比如 CHRNA7),但是尚没有发现某单一与疾病相关(详见区域感兴趣分子遗传学)。

确定序列拷贝数的组检测方法包括(CMA)分析及FISH)或多重连接依赖性探针扩增(MLPA)的靶向分析。注意:通过G显带或其他常规细胞遗传学条带技术的常规分析,不能确定15q13.3微

  • 使用寡核苷酸芯片或SNP芯片的(CMA)可以检测中的常见片段大小的检测精度取决于所使用的芯片类型及15q13.3区域中探针分布密度。
    注意:(1)大多数具有15q13.3微的个体是在发育迟缓,智力障碍或自闭症谱系障碍的病人中进行CMA而鉴定的。(2)早于2008年之前的一些芯片平台未覆盖这个区域,因而可能没能检测出这些
  • 靶向分析。技术(FISH)和多重连接依赖性探针扩增技术(MLPA)可能用于检测已知的15q13.3微的高危亲属。
    注意:(1)FISH或MLPA的靶向检测不适用于在针对15q13.3所设计的芯片中未检测到微的患者。(2)不可能常规的通过FISH或MLPA技术对微的大小进行检测。

Table 1.

  用于15q13.3微组检测方法

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1ISCA ID  2区域位置 3, 4检测方法
先症者高危亲属
15q13.3的 ~2.0-Mb 杂合ISCA-37411GRCh38/hg38 chr15: 30.5-32.5CMA  5100%100%
FISHor MLPA无此项 6100%
1.

  的详情请参阅分子遗传学

2.

组变异的标准化临床注释和解释源自临床组资源(ClinGen)项目, 即以前的国际细胞组数据标准(ISCA)联盟

3.

组坐标表示与ClinGen指定的15q13.3微相关的最小的大小。 鉴于检测实验室使用的芯片设计,坐标可能略有不同。 注意,由于在断点附近存在区段,从这些组位置计算的微的大小可能与预期的微大小不同。 在该区域内显著更大或更小的微可能在临床上与15q13.3微不同(参见遗传相关性疾病)。

4.

详见分子遗传学中关于包含在区域中的值得关注的

5.

使用寡核苷酸芯片或SNP芯片的分析(CMA)。 目前临床应用的CMA设计覆盖15q13.3区域。 注意:15q13.3微可能未被老式寡核苷酸或BAC平台检测到。

6.

FISH和MLPA不适合作为已经覆盖该区域的CMA但未检测到15q13.3微患者的诊断方法。

评估高危亲属。FISH可用于鉴定的高危亲属中的15q13.3微。父母样本的检测在确定复发风险方面很重要(参见)。

检测特点。有关检测特点(包括灵敏度和特异性)的信息,请参阅临床实用卡[Tropeano et al 2014]。

 

临床特征

临床描述

在9名智力障碍患者中首次报道了15q13.3微缺失[>Sharp et al 2008]。后续研究在智力障碍(0.3%),癫痫发作(1%-2%),精神分裂症(0.2%)以及自闭症谱系障碍(0.2%)中报告了这种微缺失较高的患病率。此外,这种微缺失在健康对照(0.02%)中偶尔发现,而在>受累>患者的健康亲属中常有发现>[ International Schizophrenia Consortium 2008, Sharp et al 2008, Stefansson et al 2008, Ben-Shachar et al 2009, Dibbens et al 2009, Helbig et al 2009, Miller et al 2009, van Bon et al 2009, de Kovel et al 2010, Masurel-Paulet et al 2010] 。>>

23838名成人对照的数据显示没有15q13.3微缺失[>Lowther et al 2015]。然而,另一项基于人群的样本(n = 101,655)的研究报告检测出25个这样的微缺失(0.025%)[>Stefansson et al 2014]。>

智力障碍和发育迟缓。统计发现,在58%的15q13.3微缺失患者中观察到智力或发育障碍>[ Lowther et al 2015] 。发育迟缓主要是言语获取和认知功能的迟缓,而不是运动障碍。 在大多数患者中认知障碍是轻度的。然而,中度至重度障碍的一部分患者也有报道>[ Ben-Shachar et al 2009, van Bon et al 2009, Lowther et al 2015] 。>

癫痫。15q13.3微缺失已被证明是癫痫的一个主要风险因素,存在于1%-2%的广泛性癫痫患者中。 统计发现,在28%的患者中确诊>存在>癫痫/癫痫发作>[ Lowther et al 2015] 。>

癫痫的类型包括青少年肌阵挛性癫痫,儿童失神性癫痫和青年期失神性癫痫>[ Dibbens et al 2009, Helbig et al 2009, de Kovel et al 2010, Mefford et al 2010] 。 癫痫发作类型包括典型的失神发作,肌阵挛发作和原发全面性强直-阵挛发作>。15q13.3微缺失在初步诊断为部分性癫痫的患者中尚未发现>[ Heinzen et al 2010] 。>

神经精神障碍。行为问题相对常见(35%),主要包括注意力差,多动症,情绪障碍,自残和侵略性和/或冲动行为。统计发现,在6.5%的患者中存在ADHD>[ Lowther et al 2015] 。>

在3项研究中发现,与对照组相比,15q13.3微缺失在精神分裂症患者群体中富集>[ International Schizophrenia Consortium 2008, Stefansson et al 2008, Lowther et al 2015]。 统计确认偏差,在11%的缺失携带者有精神分裂症,10%的>缺失携带者>有情绪障碍>[ Lowther et al 2015] 。>

据报道,11%的>15q13.3>缺失携带者>有自闭症谱系障碍,可以同时存在于智障和非智障的患者中>[ Lowther et al 2015] 。 具有自闭症谱系障碍的15q13.3微缺失的非>智障>患者可能表现为表达和书面语言受损,眼神躲避,重复运动,强迫症和多动症行为以及社交障碍>[ Miller et al 2009, Pagnamenta et al 2009] 。>

畸形和>先天性异常。一般来说,具有15q13.3微缺失的患者没有>畸形面容的特定形式。>

虽然心脏缺陷之前在具有微缺失的一部分患者中有报道>[ Sharp et al 2008, van Bon et al 2009, Masurel-Paulet et al 2010] ,但是最近的>包括所有目前已报道病例(n = 246)的>系统性综述中,强调了结构性心脏缺陷的低>外显率>(2.4%)。没有其他常见的>先天性>异常报告。>

基因型 - 表型相关性>

15q13.3微缺失>存在于从>正常到显著受累的个体>中,>没有发现有>- 相关性>。>>>>

外显率

15q13.3微缺失的>外显率>高度可变。> 总计80.5%的微缺失患者具有至少一项下列的神经发育或神经精神科诊断:智力障碍/发育迟缓,语言障碍,癫痫,自闭症谱系障碍,精神分裂症,情绪障碍和注意缺陷多动障碍>[ Lowther et al 2015] 。>

命名法> 由于15q13.3微缺失患者缺乏可识别的>,尚未以表型缩写方式进行命名。 虽然15q13.3区域包括其他区段>断点>>[>Makoff & Flomen 2007,>Shinawi et al 2009],15q13.3微缺失特指在参考基因组中30.5-32.5 Mb的近似位置2.0-Mb区域的>(>NCBI Build [hg38])。>

患病率> 患病率的估算取决于所检测患者的群体。> 在对照组中0.02%的个体发现15q13.3微缺失。> 约0.3%的智力障碍患者,1%-2%的癫痫患者,约0.2%的精神分裂症患者,以及大约0.2%的自闭症患者有15q13.3微缺失。>

 

遗传相关疾病

15q13.3微。 15q13.3区域的对应在一系列具有神经精神的患者中被观察到,包括智力障碍,自闭症谱系障碍和注意缺陷多动障碍[van Bon et al 2009,Szafranski et al 2010,Williams et al 2012]。 限于 CHRNA7的较小的15q13.3也报道与注意缺陷多动障碍相关 [Williams et al 2012]。

由于针对其他临床特征的报告病例数量有限,所以15q13.3微的相关仍然不明确。 所报告的患者的特征包括智力障碍,注意缺陷多动障碍,行为异常,自闭症谱系障碍,低血压,肥胖症和复发性耳朵感染。 无畸形特征,复发性先天异常或癫痫发作的观察报道。 这种可来源于新发突变,也可遗传自无表征的父母。 在一项23,838名个体的对照组中,检测到7个15q13.3对应(0.029%)[ Lowther et al 2015] 。

注意:(1)检测15q13.3微的方法与检测15q13.3对应的方法相同(参见建立诊断)。(2)常规中期FISH分析无法检测到15q13.3微2.0-Mb区域的,因为无法识别(或更大的信号强度)。 因此,一项正常的中期FISH研究不能排除15q13.3的可能。  FISH和MLPA的协同检查可以检测到

覆盖2.0-Mb复发性区域的15q13.3微。具有较大重叠(〜4Mb)的病例已有少量报道[ Sharp et al 2008, van Bon et al 2009, Lowther et al 2015]. 还有一些病例具有在15q13.3复发性微区域内的较小的(<700-kb)[ Hoppman-Chaney et al 2013, Lowther et al 2015] 。这些有的仅仅覆盖 CHRNA7,有的会覆盖 CHRNA7OTUD7A的第一个。最近的一项研究探讨了这两组患者中神经精神表征的患病率。尽管完善的组间分析不够全面,这项研究还是发现15q13.3复发性微和重叠亚型之间没有统计学显著差异[ Shinawi et al 2009, Lowther et al 2015] .这些患者的神经行为与15q13.3复发性微患者相似。

鉴别诊断

15q13.3微缺失的鉴别诊断包括广泛而多类别的疾病。 它包括发育迟缓,精神分裂症,孤独症谱系障碍和癫痫的任何原因,而没有额外的突出临床特征。

 

管理

初步诊断后评估

为了确定15q13.3微的疾病程度和需求,建议进行以下评估:

  • 常规临床检查
  • 包括言语评估在内的认知评估
  • 临床心理学家进行神经心理以及发育的评估,以帮助确定后续治疗的需要
  • 如果怀疑癫痫,则进行脑电图和神经系统检查
  • 心脏超声评估
  • 咨询临床遗传学家和/或

表征的治疗

理想的治疗方式是进行个体化对症治疗。 由于神经发育障碍的发生率高,建议转诊至临床心理学专家以获得神经心理和/或发育评估的治疗建议。

考虑到患者的年龄和具体的表征,对心脏缺陷,癫痫,孤独症谱系障碍和精神分裂症患者的医学治疗应遵循这些疾病的标准做法。

没有必要对携带有15q13.3微的健康成年人进行额外处理,尽管了解他们潜在的迟发性表征(如精神分裂症)风险增加的可能对他们的医疗保健提供者有所帮助。

监测

对于15q13.3微的所有儿童,儿童期建议对神经认知发展和发展进程进行密切评估/监测,如有需要,可转而介入进行早期干预。

考虑到患者的年龄和具体表征,对心脏缺陷,癫痫,孤独症谱系障碍和精神分裂症患者的医疗检测应遵循这些疾病的标准操作。

需规避的物品及环境

大约10%的15q13.3微患者会发展为精神分裂症。据报道,大麻的使用会成为精神分裂症发展的风险因素。虽然没有对15q13.3微患者使用大麻而增加潜在风险进行研究,但可以考虑劝阻其使用大麻。

风险亲属的评估

使用组检测法检测中发现的15q13.3微,建议尽可能早的评估较年长和较年幼的同胞以便确诊,这将有助于密切评估/监测童年时期的发育进程。
就风险亲属与检测相关的问题,请参阅

在研治疗

搜索ClinicalTrials.gov获取关于各种疾病和病症的临床研究信息。

 

遗传咨询

是向个人和家庭提供关于遗 传疾病的性质,遗传和影响的信息,以帮助他们做出明智的医疗和个人决定的过程。 以下部分涉及遗传风险评估和使用家族史及遗传检测来明确家庭成员的遗传状况的内容。 本节并不意味着能解决患者面临的所有个人,文化或伦理问题,或替代遗传学专业人士的咨询。-ED。

 

15q13.3微是以显性方式遗传的; 大约15%的新发突变,而85%从遗传自父母。

家庭成员风险

父母

的同胞

  • 同胞的风险取决于其父母的遗传状况。
  • 如果在中确定的15q13.3微没有在其父母身上检测到,则其同胞的风险较低(<1%),但其风险仍大于普通人群,因为微存在亲本的可能。
  • 如果其双亲之一携带15q13.3微,则每个同胞遗传微的风险为50%。 然而,不可能可靠地预测个体的

的后代。    具有15q13.3微个体的后代有50%的可能性遗传微

其他家庭成员

  • 其他家庭成员的风险取决于父母的遗传状况。
  • 如果父母一方携带15q13.3微,其家庭成员也可能携带微

相关问题

参见管理,风险亲属评估的信息,以便于以早期诊断和治疗为目的的对风险亲属进行评估。

计划生育

  • 确认遗传风险及产前检测可行性讨论的最佳时间是在怀孕之前。 同样地,关于通过检测以确定无症状家族成员的遗传状况的决定最好是在怀孕前进行。
  • 向有可能生育15q13.3微孩子的年轻成人提供(包括讨论后代的潜在风险和生殖选择)是适当的。

DNA样本保存是以备日后使用而做的DNA的储备(通常从白细胞中提取)。因为检测方法和我们对变异以及疾病的理解可能会在未来有所改善,所以考虑对受累人群推荐存储DNA。

产前检测

已知15q13.3微高风险的孕产妇。当已发现有15q13.3微,就以下情况可开展基于产前检测:

没有15q13.3微高风险的孕产妇。 没有15q13.3微高风险的孕产妇在进行的CMA时可能会检测到此微

注意:根据15q13.3微的产前检测结果,不能可靠地预测(参见)。


(PGD)可能是一些确认有微家庭的选择。

 

资源

GeneReviews staff has selected the following disease-specific and/or umbrella support organizations and/or registries for the benefit of individuals with this disorder and their families. GeneReviews is not responsible for the information provided by other organizations. For information on selection criteria, click here.

  • Chromosome Disorder Outreach (CDO)
    PO Box 724
    Boca Raton FL 33429-0724
    Phone:561-395-4252 (Family Helpline)
    Email:info@chromodisorder.org
  • Unique: The Rare Chromosome Disorder Support Group
    G1 The Stables
    Station Road West
    Oxted Surrey RH8 9EE
    United Kingdom
    Phone:+44 (0) 1883 723356
    Email:info@rarechromo.org; rarechromo@aol.com
 

分子遗传学


分子遗传学和OMIM表中的信息可能与GeneReview中的其他信息不同:表可能包含更多最新信息。-ED。

Table A.

15q13.3微和数据库

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数据来自以下标准参考文献:信息来自HGNC; ,临界区域,OMIM互补基团;蛋白质信息来自UniProt。 有关提供链接的数据库(Locus Specific,HGMD)的描述,请点击此处。

Table B.

OMIM Entries for 15q13.3 Microdeletion ( View All in OMIM)

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118511CHOLINERGIC RECEPTOR, NEURONAL NICOTINIC, ALPHA POLYPEPTIDE 7; CHRNA7
605328KRUPPEL-LIKE FACTOR 13; KLF13
612001CHROMOSOME 15q13.3 DELETION SYNDROME

分子遗传病理学

机制。 近着丝粒15q区域具有高密度的低拷贝[ Bailey et al 2002, Makoff & Flomen 2007, Sharp et al 2008] ,因此易受组重排而导致部分非整倍体。 这种重排的断点(BP)富集于低拷贝中。 迄今为止,15q11q14区域已有6个断点已被详细描述[ Mignon-Ravix et al 2007] 。 复发性的2.0-Mb 15q13.3微发生在断点4和断点5之间[ Sharp et al 2008] 。

当断点4-断点5区域的常见倒置导致侧翼低拷贝位于同向状态时,通过诱发同源最终导致2.0-Mb微[Sharp et al 2008]。

该区域的值得关注的。这种2.0Mb微导致了六个已知的丢失: MTMR15,TRPM1,MTMR10,KLF13,OTUD7ACHRNA7。 这些是如何导致该综合征的临床表征仍不清楚,但正在进行的调查研究可能会确定出一种或多种特征的影响。

在发育迟缓,智力障碍,自闭症谱系障碍,癫痫和精神分裂症患者(参见遗传相关性障碍)中已发现只覆盖CHRNA7的较小的15q13.3,因此将 CHRNA7作为15q13.3微的神经精神症状的主要候选CHRNA7编码介导神经元信号传递的突触离子通道蛋白[ Taske et al 2002, Hong et al 2004, Leonard & Freedman 2006, Iwata et al 2007] 。 迄今为止,尚无在CHRNA7中具有致病性功能丧失变异的个体报道。

 

参考文献

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Chapter Notes

Author Notes

15q13.3 Research Project

The aim of the 15q13.3 research project is to gain more understanding of the great variabilty in the clinical spectrum associated with this .

Revision History

  • 23 July 2015 (me) Comprehensive update posted live
  • 23 December 2010 (me) Review posted live
  • 18 May 2010 (bwmvb) Original submission